La ruta absoluta del dominio es:

/web/htdocs/www.sudominio.ext/home/

Por lo tanto, insertando un archivo desde el nombre nombre_archivo.ext en la raíz del dominio, su ruta absoluta será: /web/htdocs/www.sudominio.ext/home/nombre_archivo.ext

Para los dominios de Tercer Nivel, la ruta absoluta es:

/web/htdocs/nombretercernivel.nombredominio.ext/home/

Para más detalles está disponible la siguiente guía: Archivo Perl y Permisos CHMOD