Si un script puesto en la cgi_bin para todas ejecuciones pone “Internal Server Error”

Todos los cgi deben:
1) ser trasferidos por FTP en modalidad ASCII o AUTO
2) tener permisos 755

Ver detalles en esta dirección.

Si una de estas reglas no es respetada, el error visualizado será Internal Server Error.
Si el error permanece le aconsejamos que utilice la función "Visualiza Log de los Errores" en el panel de control del hosting linux en la dirección
http://www.sudominio.com/login.

Las mismas cosas son para los script en php que dan Internal Server Error.